Ban triển khai dự án TABMIS do Ban chỉ đạo dự án cải cách quản lý tài chính công (Bộ tài chính) thành lập bao gồm:
Tổng giám đốc KBNN làm trưởng ban triển khai. Giúp việc cho ban triển khai gồm các đồng chí là lãnh đạo một số đơn vị thuộc Bộ tài chính, Văn phòng ban triển khai, các nhóm giải pháp nghiệp vụ, nhóm giải pháp kỹ thuật, nhóm kiểm tra thử nghiệm, nhóm đào tạo và quản lý chuyển đổi, nhóm triển khai.